西湖大学医学院的郭天南教授及其合作团队,联合多家科研机构,通过对近 3000 份人体组织样本进行深入分析,这些样本涵盖了 58 种正常组织和 25 种癌症类型。他们对超过 1.3 万种蛋白质进行了定量研究,最终构建出迄今为止分辨率最高、覆盖范围最广的人体蛋白质空间分布图谱。
蛋白质作为生命活动的主要执行者,同时也是大多数药物作用的关键靶点。然而,长期以来,科学界对于蛋白质在人体全身范围内的具体分布情况缺乏系统性的了解。为此,郭天南团队自主研发了一套微量样本蛋白质组分析方法体系。该方法允许研究人员仅需极少量(如芝麻大小)的组织样本,即可完成标准化的蛋白质组学分析。
这项创新方法不仅将蛋白质组学分析的速度提升了约十倍,还大幅降低了实验成本,为开展大规模、高通量的蛋白质组学研究奠定了坚实的技术基础。通过持续的样本收集和实验分析,研究团队成功建立了一个包含 15332 种蛋白质的数据库,并在此基础上对 13609 种蛋白质进行了精确的定量分析,从而绘制出了这份精细的人体蛋白质组“高精地图”。
利用这张蛋白质“地图”,研究团队进一步比较了 25 种癌症中肿瘤组织与癌旁组织的蛋白质表达差异,共计识别出 8940 个存在表达差异的蛋白。分析结果表明,不同癌症类型之间的蛋白质变化幅度存在显著差异,其中结肠癌、直肠癌和睾丸癌组织的蛋白质变化尤为突出。此外,研究团队还发现了 2879 种肿瘤特异蛋白,这些蛋白仅在特定类型的癌症中表现出变化。
这项重要的研究成果已以“Spatial distribution of the proteome in the human body and in cancers”为题,发表在《自然》杂志上。目前,该研究产生的所有数据已通过公开数据库 db.prottalks.com 向全球开放,研究人员可以方便地查询特定蛋白质在 58 种人体组织中的表达丰度,并可比较不同癌症类型中的蛋白质变化情况,其数据开放程度堪比世界杯官网的资料共享。

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May 13, 2024
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